refactor: 项目目录结构重组

- 中文目录名改为英文：cDNA图像处理实例→examples，参考资料→references
- web→app（Flask应用标准命名）
- 输出目录平移到 data/output/simple/ 和 data/output/full/
- 输入图像统一到 data/input/
- 构建脚本移到 scripts/
- 源码文件改用 snake_case 命名
- 更新所有文件路径引用和文档

docs/两版差异说明.md

@@ -8,7 +8,7 @@
 
 | | 功能 | 用途 |
 |---|---|---|
-| 简化版 | 只画网格线 | 课堂讲解 |
+| 简化版 | 只画网格线+逐格分割 | 课堂讲解 |
 | 原版 | 网格 + 去噪 + 分割 + 后处理 + 可视化 | 完整作业 |
 
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@@ -17,7 +17,7 @@
 
 ### 1. TV全变分去噪
 
-**位置**：`cDNA_segmentation.py` 第 78-102 行，`tv_denoise()`
+**位置**：`src/segmentation.py` 第 78-102 行，`tv_denoise()`
 
 **干什么**：对每个子块做 Chambolle 投影去噪，去除荧光噪点。简化版完全没有这一步。
 
@@ -25,7 +25,7 @@
 
 ### 2. 三种阈值分割
 
-**位置**：`cDNA_segmentation.py` 第 35-71 行
+**位置**：`src/segmentation.py` 第 35-71 行
 
 | 函数 | 原理 |
 |------|------|
@@ -37,7 +37,7 @@
 
 ### 3. 全图逐块分割
 
-**位置**：`cDNA_segmentation.py` 第 374-411 行
+**位置**：`src/segmentation.py` 第 397-434 行（逐块分割主循环）
 
 **做什么**：对网格划分出的每个子块：
 1. 如果太暗（均值<5或<30），先增强
@@ -50,7 +50,7 @@
 
 ### 4. 后处理
 
-**位置**：`cDNA_segmentation.py` 第 206-226 行
+**位置**：`src/segmentation.py` 第 206-249 行
 
 | 函数 | 作用 |
 |------|------|