Serendipity/cDNA-image-processing
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Serendipity e21595e72c docs: 更新README，新增Web应用和打包说明 
- 新增Flask Web应用介绍和三种运行方式
- 新增PyInstaller打包流程
- 更新项目结构，包含web/、build_exe.py等
- 精简两版实现描述，突出各自特点

Co-Authored-By: Claude Opus 4.7 <noreply@anthropic.com>
 2026-05-08 21:41:03 +08:00
Serendipity dd145d7651 docs: 依赖库清单 2026-05-08 16:30:32 +08:00
Serendipity 8d81c20032 chore: .gitignore增加PyInstaller产物，移除已提交的spec 2026-05-08 16:28:40 +08:00
Serendipity 187068f6cc build: 优化PyInstaller打包，排除无关包，exe缩小到68MB 2026-05-08 16:23:44 +08:00
Serendipity a5f4275e19 build: PyInstaller打包配置+启动器 2026-05-08 16:15:45 +08:00
Serendipity c7ba14a81a Revert: pct改回T/255，T/2550会破坏暗图处理 2026-05-08 16:08:47 +08:00
Serendipity 4dab42e932 fix: pct计算改为T/2550 2026-05-08 15:54:12 +08:00
Serendipity 06159eba19 style: 深蓝+白色学术风格重设计 
替代荧光绿实验室主题，更干净专业
 2026-05-08 15:49:39 +08:00
Serendipity 8657937214 fix: 用os.startfile替代webbrowser打开浏览器 2026-05-08 15:42:36 +08:00
Serendipity d180ec5e56 feat: 启动Flask时自动打开Edge浏览器 2026-05-08 15:38:32 +08:00
Serendipity 1041a66270 refactor: remove_small_objects用Otsu替代中位数25% 
对连通域面积分布做Otsu自动找分界，不再拍脑袋定百分比
 2026-05-08 15:31:47 +08:00
Serendipity b07e7a1182 feat: Flask Web UI — 在线cDNA图像处理平台 
- 上传图像 + 实时处理 + 6张结果可视化
- 实验室仪器风格深色主题
- 参数统计面板（T/pct/网格/斑点数）
- 图片点击放大 + 单张/全部下载
 2026-05-08 11:26:02 +08:00
Serendipity 862d02dce6 fix: 移动flowchart.drawio到项目根目录 2026-05-08 10:47:16 +08:00
Serendipity 34889647f8 docs: 更新流程图，补充分割/后处理/统计/可视化步骤 2026-05-08 10:33:04 +08:00
Serendipity 99c9d0263a feat: 简化版可视化拆分为6张独立图片 
01_grid_overlay.png - 网格线叠加
02_col_projection.png - 列投影曲线
03_row_projection.png - 行投影曲线
04_histogram.png - 直方图+Otsu阈值
05_segmentation_raw.png - 逐格分割(后处理前)
06_post_processed.png - 最终二值图
 2026-05-08 10:08:00 +08:00
Serendipity 70790c1d3e refactor: 用户调整注释格式 2026-05-08 09:58:57 +08:00
Serendipity f95e3de5bd refactor: 恢复简化版所有详细行内注释 
每函数、每关键行都有中文注释说明原理
 2026-05-08 09:55:38 +08:00
Serendipity dae90a8de0 feat: 简化版增加逐格分割+后处理+斑点统计 
现在简化版也具备完整处理链：
网格划线 → 逐格Otsu → keep_largest_object → remove_small_objects → 统计
输出三栏图：网格/分割/后处理结果
 2026-05-08 09:40:37 +08:00
Serendipity 085c27c050 refactor: 后处理阈值完全自动化，零人工参数 
- keep_largest_object: 每格仅留最大块，不设最低门槛
- remove_small_objects: 统计全局面积中位数，<25%自动判定为噪声
 2026-05-08 08:57:48 +08:00
Serendipity efc6704b14 refactor: 后处理min_size改为格子面积百分比，自适应不同分辨率 
keep_largest_object: 格子面积的1%
remove_small_objects: 格子面积的2%
 2026-05-08 08:54:47 +08:00
Serendipity 00836cd302 refactor: 重写注释，统一风格 
- 顶部docstring改为算法流程总览+各步骤详解
- 两个函数各配职责明确的注释
- 主流程三个步骤注释简洁
 2026-05-08 08:44:34 +08:00
Serendipity e726e62c44 refactor: 简化版用Otsu自适应百分比替代写死的10% 
百分比 = T/255，自动根据图像数据推导，无需人为设定
 2026-05-08 08:40:45 +08:00
Serendipity 52a6e1b244 docs: CLAUDE.md更新仓库地址（SSH优先，HTTPS备选） 2026-05-08 08:27:56 +08:00
Serendipity 8e30fd585b feat: 简化版增加Otsu阈值分割 
输出改为左右对比图（网格划线 vs Otsu分割）
 2026-05-08 08:23:16 +08:00
Serendipity bad3635f0a feat: 原版增加斑点数量统计 
输出检测到的有效斑点数、面积统计（最小/最大/均值/中位数）
 2026-05-07 22:09:13 +08:00
Serendipity 09d8b9d8fe docs: 添加两版差异说明文档 2026-05-07 21:49:01 +08:00
Serendipity d273d45a5b 删除 2026-05-07 19:19:12 +08:00
Serendipity ad14755405 测试 2026-05-07 19:16:26 +08:00
Serendipity 918bdbf939 docs: 更新教程文档，去除不必要的路径信息 2026-05-07 08:28:43 +08:00
Serendipity 5a23b16a59 docs: 更新算法步骤说明，去除不必要的路径信息 2026-05-07 08:17:10 +08:00
Serendipity d4b6fa6b53 chore: 更新.gitignore和教程文档 2026-05-06 22:43:49 +08:00
Serendipity 7ec449ce3f docs: 重写README，聚焦Python实现 
- 以两个Python脚本为核心
- 两版对比表格
- 输出文件说明
- 运行命令
 2026-05-06 22:40:14 +08:00
Serendipity 59e3de24a8 docs: 更新流程图（Draw.io修复格式） 2026-05-06 22:38:29 +08:00
Serendipity dd320a6012 feat: 简化版算法流程图（draw.io格式） 
用Draw.io打开 results_simple/flowchart.drawio 即可查看
涵盖10个步骤：读取→灰度→投影→阈值→减阈值→正负判断→过零点→配对→划线→输出
 2026-05-06 22:35:26 +08:00
Serendipity ac8e438954 docs: CLAUDE.md增加编码规范——禁止硬编码绝对路径 2026-05-06 22:20:33 +08:00
Serendipity 16c93c7e64 docs: 简化版逐行代码讲解教程 
190行代码逐一解析，含ASCII图解、数据流演示、课堂建议
 2026-05-06 22:10:18 +08:00
Serendipity 249779ae72 docs: 重写README突出作业实现，新增CLAUDE.md 
README: 以"我的Python实现"为中心，对比原版与简化版
CLAUDE.md: 项目概述、算法要点、文件结构
 2026-05-06 20:23:21 +08:00
Serendipity ad8e5041f2 feat: 简化版网格划分算法，适合课堂讲解 
算法流程（仅划线，不分割）：
1. 彩色图转灰度图
2. 横/纵轴投影：每列/行灰度值求和
3. 阈值 X = (max-min) × 10%
4. 曲线减去 X，正=斑点，负=空隙
5. 过零点配对，中点即划线位置

与原版误差为0，代码带详细中文注释。
 2026-05-06 20:21:19 +08:00
Serendipity b8a8ff2bc6 feat: cDNA微阵列图像处理作业 - Python实现 
实现内容：
- 网格划分：投影分析 + 自相关估周期 + 白顶帽去背景 + 质心提取
- 三种阈值分割：人工阈值、Otsu自动阈值、迭代阈值
- TV去噪（Chambolle投影算法）
- 后处理：去小连通域 + 保留最大连通域
- 完整可视化：网格叠加、阈值对比、收敛曲线、分割结果

参考MATLAB代码：NewGridAndCV/demo_GriddingAndCV.m
 2026-05-06 19:41:26 +08:00